Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SIN3AQ96ST3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SIN3AQ96ST3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SIN3AQ96ST3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SIN3AQ96ST3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SIN3AQ96ST3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 659.6 ms