Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DEPDC7Q96QD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DEPDC7Q96QD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEPDC7Q96QD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC7Q96QD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms