Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNGAP1Q96PV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNGAP1Q96PV0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYNGAP1Q96PV0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms