Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf85Q96MD7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf85Q96MD7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf85Q96MD7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf85Q96MD7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms