Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC34Q96HJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC34Q96HJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC34Q96HJ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC34Q96HJ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC34Q96HJ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms