Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNF8Q96H20 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNF8Q96H20 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNF8Q96H20 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNF8Q96H20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNF8Q96H20 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms