Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP4Q96EB1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ELP4Q96EB1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELP4Q96EB1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ELP4Q96EB1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms