Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VTI1AQ96AJ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VTI1AQ96AJ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VTI1AQ96AJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VTI1AQ96AJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VTI1AQ96AJ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms