Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTF3C6Q969F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF3C6Q969F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTF3C6Q969F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTF3C6Q969F1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GTF3C6Q969F1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms