Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC9Q92623 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC9Q92623 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC9Q92623 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC9Q92623 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms