Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L4Q8TEY5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CREB3L4Q8TEY5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREB3L4Q8TEY5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms