Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRSK1Q8TDC3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRSK1Q8TDC3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
BRSK1Q8TDC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRSK1Q8TDC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms