Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DTX3LQ8TDB6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DTX3LQ8TDB6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DTX3LQ8TDB6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DTX3LQ8TDB6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms