Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF169Q8NCN4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF169Q8NCN4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF169Q8NCN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF169Q8NCN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms