Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AVL9Q8NBF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AVL9Q8NBF6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AVL9Q8NBF6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AVL9Q8NBF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms