Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC33Q8N5R6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC33Q8N5R6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC33Q8N5R6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC33Q8N5R6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms