Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC65Q8IXS2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC65Q8IXS2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC65Q8IXS2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC65Q8IXS2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms