Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NME9Q86XW9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NME9Q86XW9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NME9Q86XW9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NME9Q86XW9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms