Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT25Q7Z3Z0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT25Q7Z3Z0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT25Q7Z3Z0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT25Q7Z3Z0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms