Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX6Q7RTT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX6Q7RTT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSX6Q7RTT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX6Q7RTT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms