Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CYFIP1Q7L576 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYFIP1Q7L576 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYFIP1Q7L576 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYFIP1Q7L576 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms