Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHISA6Q6ZSJ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHISA6Q6ZSJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHISA6Q6ZSJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHISA6Q6ZSJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 467.2 ms