Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VSTM1Q6UX27 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VSTM1Q6UX27 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VSTM1Q6UX27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSTM1Q6UX27 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms