Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWM7

LCTL, Lactase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTLQ6UWM7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCTLQ6UWM7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LCTLQ6UWM7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LCTLQ6UWM7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCTLQ6UWM7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms