Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNCKQ6P2M8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNCKQ6P2M8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNCKQ6P2M8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNCKQ6P2M8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNCKQ6P2M8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms