Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf33Q6P1S2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf33Q6P1S2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf33Q6P1S2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms