Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDE2Q6IQ49 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDE2Q6IQ49 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDE2Q6IQ49 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDE2Q6IQ49 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms