Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRAMD4Q6IC98 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRAMD4Q6IC98 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRAMD4Q6IC98 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRAMD4Q6IC98 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms