Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN90

IQSEC1, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC1Q6DN90 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IQSEC1Q6DN90 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQSEC1Q6DN90 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQSEC1Q6DN90 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQSEC1Q6DN90 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC1Q6DN90 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQSEC1Q6DN90 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC1Q6DN90 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC1Q6DN90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQSEC1Q6DN90 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQSEC1Q6DN90 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms