Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf140Q5VVS0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf140Q5VVS0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf140Q5VVS0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf140Q5VVS0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms