Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF17Q5VTA0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF17Q5VTA0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF17Q5VTA0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF17Q5VTA0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF17Q5VTA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms