Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDZK1Q5T2W1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZK1Q5T2W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDZK1Q5T2W1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms