Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MARCH8Q5T0T0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARCH8Q5T0T0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MARCH8Q5T0T0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MARCH8Q5T0T0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms