Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNFAIP8L3Q5GJ75 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms