Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC38Q502W7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC38Q502W7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC38Q502W7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC38Q502W7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms