Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM71Q2Q1W2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM71Q2Q1W2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM71Q2Q1W2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM71Q2Q1W2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms