Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGCBQ16585 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SGCBQ16585 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGCBQ16585 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SGCBQ16585 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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