Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC18A3Q16572 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC18A3Q16572 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC18A3Q16572 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC18A3Q16572 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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