Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITSN1Q15811 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITSN1Q15811 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITSN1Q15811 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ITSN1Q15811 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ITSN1Q15811 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITSN1Q15811 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITSN1Q15811 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
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