Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAM2Q15035 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAM2Q15035 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAM2Q15035 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
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