Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNIP1Q15025 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNIP1Q15025 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNIP1Q15025 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNIP1Q15025 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms