Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME4Q14997 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PSME4Q14997 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
PSME4Q14997 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PSME4Q14997 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSME4Q14997 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
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