Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEDD9Q14511 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEDD9Q14511 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD9Q14511 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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