Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAB33AQ14088 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB33AQ14088 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB33AQ14088 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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