Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSTA3Q13630 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSTA3Q13630 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSTA3Q13630 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSTA3Q13630 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSTA3Q13630 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSTA3Q13630 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSTA3Q13630 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSTA3Q13630 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSTA3Q13630 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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