Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGCGQ13326 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGCGQ13326 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SGCGQ13326 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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