Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DUSP4Q13115 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DUSP4Q13115 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP4Q13115 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP4Q13115 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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