Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF3Q13114 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF3Q13114 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF3Q13114 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF3Q13114 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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