Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRDNQ13061 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRDNQ13061 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRDNQ13061 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRDNQ13061 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRDNQ13061 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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