Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK2Q13002 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK2Q13002 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK2Q13002 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK2Q13002 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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